Sous la direction du Comité Olympique du Panama travaillent en tout 16 Fédérations Nationales ayant une certaine autonomie. Du point de vue internationale leurs activités doivent être avalisées par le COP, seule institution juridiquement reconnue par le COI, dont le siège est à Lausanne, Suisse.

Les entités reconnues officiellement par le COP sont celles qui suivent:

Fédération Panaméenne de Soft-ball.

Fédération Panaméenne de Boxe Amateur

Fédération Panaméenne de Basket-ball

Fédération Panaméenne de Judo

Fédération Panaméenne de Lutte Amateur

Fédération Panaméenne de Natation

Fédération Panaméenne d' Haltérophilie.

Fédération Panaméenne de Tennis

Fédération Panaméenne de Volley-ball

Fédération Panaméenne de Physi-culturisme

Fédération Panaméenne de Karaté

Fédération Panaméenne de Base-ball

Fédération Panaméenne de Football

Fédération Panaméenne Cyclisme

Fédération Panaméenne d'Athlétisme.

Fédération Panaméenne de Billar